创新中心具备独立企业法人的公司治理结构：决策机构股东会，其下有董事会、监事会，董事会下有CEO（首席执行官）及专家委员会指导。目前在CEO领导下的执行班子，包含COO(首席运营官)、CTO（首席技术官）、CFO(首席财务官)以及其它职能部门，例如综合办公室、人力资源部、合规部。COO(首席运营官)下辖管理广州产业化基地、战略合作部、知识产权运营部、产业基金部以及项目部，CTO（首席技术官）下辖管理前端采集实验室、内容制作实验室、编解码研究实验室、网络传输实验室、超高清+AI应用实验室、测试验证实验室，CFO（首席财务官）下辖管理财务管理中心。